RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462078.1

POLR1A-205, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 469 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-205ENST00000462078 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF365Q70YC5 407 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 MICU3Q86XE3 530 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HERVK_113Q902F9 699 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GUCD1Q96NT3 240 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PITPNM1O00562 1244 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZBTB43O43298 467 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 REC8O95072 547 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GGPS1O95749 300 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ACRP10323 421 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CYP2C9P11712 490 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CPA1P15085 419 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HOXC8P31273 242 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RTN1Q16799 776 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 USP26Q9BXU7 913 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.07□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 WDR81Q562E7 1941 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 FIBPO43427 364 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PFKMP08237 780 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 IQCF3P0C7M6 154 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RPS6KB1P23443 525 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PSEN2P49810 448 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CCL23P55773 120 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HIC1Q14526 733 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GPNMBQ14956 572 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GNPTABQ3T906 1256 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 METTL7BQ6UX53 244 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CUL5Q93034 780 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 STXBP3O00186 592 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 FGBP02675 491 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ITGB5P18084 799 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RFC2P35250 354 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 NEDD9Q14511 834 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 MFSD10Q14728 455 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 NTRK3Q16288 839 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PTGISQ16647 500 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 Q6ZUG5 572 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 CAGE1Q8TC20 777 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GPRASP2Q96D09 838 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SCLYQ96I15 445 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 SPATA33Q96N06 139 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GPR20Q99678 358 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 BARHL2Q9NY43 387 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.05□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 MAFGO15525 162 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ATP9AO75110 1047 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 NEFLP07196 543 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF286BP0CG31 522 aa11.04□□□□□ -0.64
POLR1A-205ENST00000462078 KCNA2P16389 499 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms