RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 GPATCH3Q96I76 525 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 JAM3Q9BX67 310 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MCM8Q9UJA3 840 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R2C6 588 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 TACR1P25103 407 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 EMC4Q5J8M3 183 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CBLL1Q75N03 491 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CHST14Q8NCH0 376 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC14L1Q92503 715 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PEX11GQ96HA9 241 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 GAS7O60861 476 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 NTRK1P04629 796 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-205ENST00000462042 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 TADA3O75528 432 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 OSTM1Q86WC4 334 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SCYL1Q96KG9 808 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
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