RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.67□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 CERS5Q8N5B7 392 aa5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.67□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 THEGQ9P2T0 379 aa5.66□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.66□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.66□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 AP3B2Q13367 1082 aa5.65□□□□□ -1.5
CNN3-204ENST00000461018 DSC3Q14574 896 aa5.65□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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CNN3-204ENST00000461018 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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CNN3-204ENST00000461018 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.64□□□□□ -1.51
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CNN3-204ENST00000461018 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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CNN3-204ENST00000461018 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.64□□□□□ -1.51
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CNN3-204ENST00000461018 PRKAR2BP31323 418 aa5.63□□□□□ -1.51
CNN3-204ENST00000461018 ADMP35318 185 aa5.63□□□□□ -1.51
CNN3-204ENST00000461018 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
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CNN3-204ENST00000461018 MAP7Q14244 749 aa5.63□□□□□ -1.51
CNN3-204ENST00000461018 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.63□□□□□ -1.51
CNN3-204ENST00000461018 ABI1Q8IZP0 508 aa5.63□□□□□ -1.51
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