RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 CABYRO75952 493 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 RGS20O76081 388 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 USP11P51784 963 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ARHGAP4P98171 946 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 JADE2Q9NQC1 790 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 PHF24Q9UPV7 400 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 COL6A1P12109 1028 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 KCNA10Q16322 511 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 LY6KQ17RY6 165 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 FRMPD3Q5JV73 1810 aa26.73■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ARIH2O95376 493 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 KRT2P35908 639 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 MTMR1Q13613 665 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 CEP55Q53EZ4 464 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 PGBD1Q96JS3 809 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 C8orf76Q96K31 380 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.72■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 M0R2N6 131 aa26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ACLYP53396 1101 aa26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.71■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 A6NJR5 290 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MMP1P03956 469 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SNX21Q969T3 373 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 LAMA3Q16787 3333 aa26.7■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ELP1O95163 1332 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ASGR1P07306 291 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ITGB5P18084 799 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 CIITAP33076 1130 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 KRT40Q6A162 431 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.69■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MEIS1O00470 390 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 CTAGE5O15320 804 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 GGPS1O95749 300 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ARHGAP1Q07960 439 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 NPY5RQ15761 445 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 METTL7BQ6UX53 244 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 PPTC7Q8NI37 304 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 TBCKQ8TEA7 893 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 COPS5Q92905 334 aa26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 BEX3Q00994 111 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 CUL4AQ13619 759 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 DGKDQ16760 1214 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.67■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PQY0 241 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MYADML2A6NDP7 307 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 PPFIA4O75335 1185 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SP2Q02086 613 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 HSCBQ8IWL3 235 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SPATA33Q96N06 139 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 PRO3102Q9H379 93 aa26.66■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.66■■□□□ 1.86
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GLI3-202ENST00000428534 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 AFG1LQ8WV93 481 aa26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 SDF4Q9BRK5 362 aa26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.65■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 ADAMTS3O15072 1205 aa26.64■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 MMP3P08254 477 aa26.64■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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