RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427196.1

HCG25-218, Transcript of HLA complex group 25, humanhuman

TSL 2

Gene HCG25, Length 677 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG25-218ENST00000427196 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MROH8Q9H579 483 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 RNF146Q9NTX7 359 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ABCB11O95342 1321 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PRR23AA6NEV1 266 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 NFIBO00712 420 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ADAMTS3O15072 1205 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CDKL5O76039 1030 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ARHGEF15O94989 841 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 DEXIO95424 95 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SLC25A27O95847 323 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CSF2RAP15509 400 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PTPREP23469 700 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CYP2C19P33261 490 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 FOSBP53539 338 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CUL4AQ13619 759 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TKFCQ3LXA3 575 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 GPR142Q7Z601 462 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 HSCBQ8IWL3 235 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CHST13Q8NET6 341 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 USP6NLQ92738 828 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 STK36Q9NRP7 1315 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 POTEB3A0JP26 581 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 STXBP3O00186 592 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 COBLO75128 1261 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PGK2P07205 417 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 FCER1AP12319 257 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 KCNA5P22460 613 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MAPK4P31152 587 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 RGS2P41220 211 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 NAPAP54920 295 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MORN1Q5T089 497 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 POTEBQ6S5H4 581 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 NSMFQ6X4W1 530 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 RMDN1Q96DB5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MMP19Q99542 508 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ALG1Q9BT22 464 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ACAD9Q9H845 621 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 BARHL2Q9NY43 387 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PNMA2Q9UL42 364 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TRPC6Q9Y210 931 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SMCO2A6NFE2 343 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 H0Y858 1186 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 STRNO43815 780 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CFBP00751 764 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CA3P07451 260 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CALML3P27482 149 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 GJB2P29033 226 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ADORA2AP29274 412 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 COPB2P35606 906 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CNTN2Q02246 1040 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 FAAP100Q0VG06 881 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TRAF1Q13077 416 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 GRB14Q14449 540 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 LRRC41Q15345 812 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 UBE2SQ16763 222 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms