RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 ICAM3P32942 547 aa28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SEMA3FQ13275 785 aa28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 LAMC2Q13753 1193 aa28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SORBS3O60504 671 aa28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 Q7L0L9 218 aa28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TBX21Q9UL17 535 aa28.44■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ADAMTS3O15072 1205 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 GNPTABQ3T906 1256 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 C8orf34Q49A92 452 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.43■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 COL6A3P12111 3177 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 GGPS1O95749 300 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ADCY7P51828 1080 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 STK3Q13188 491 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 DEFB123Q8N688 67 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 PGBD1Q96JS3 809 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM260Q9NX78 707 aa28.42■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 RAG1P15918 1043 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SHHQ15465 462 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 PPTC7Q8NI37 304 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 KAT2BQ92831 832 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.41■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 FIBPO43427 364 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 B4GALT4O60513 344 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ITGB5P18084 799 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 DGKDQ16760 1214 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.4■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 TIMP1P01033 207 aa28.39■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 SPATA33Q96N06 139 aa28.39■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.39■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.39■■■□□ 2.14
CCZ1B-202ENST00000411858 PPFIA4O75335 1185 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 AK2P54819 239 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 NLRX1Q86UT6 975 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.38■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 ESYT2A0FGR8 921 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 ATP9AO75110 1047 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 EPHB4P54760 987 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 SCRN1Q12765 414 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 NEDD9Q14511 834 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 GPRASP2Q96D09 838 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 ANO3Q9BYT9 981 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.37■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 CHMP4BP1P59074 171 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 C6orf50Q9HD87 102 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 JADE2Q9NQC1 790 aa28.36■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 CPLX1O14810 134 aa28.35■■■□□ 2.13
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CCZ1B-202ENST00000411858 AP3B2Q13367 1082 aa28.35■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.35■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 METTL7BQ6UX53 244 aa28.35■■■□□ 2.13
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CCZ1B-202ENST00000411858 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.35■■■□□ 2.13
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CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF286BP0CG31 522 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 NEK4P51957 841 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKRD1Q15327 319 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 MFSD5Q6N075 450 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.34■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 DTNBO60941 627 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 KCNA2P16389 499 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 CYP2C18P33260 490 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 SREBF1P36956 1147 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 PSEN2P49810 448 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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