RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 THAP9Q9H5L6 903 aa20.39■□□□□ 0.86
TM2D2-201ENST00000397070 VAV3Q9UKW4 847 aa20.39■□□□□ 0.86
TM2D2-201ENST00000397070 RPA1P27694 616 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 P2RX5Q93086 422 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KLRG1Q96E93 195 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEB3A0JP26 581 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTECB2RU33 542 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ZBED4O75132 1171 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 STAT3P40763 770 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 EHHADHQ08426 723 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KRT31Q15323 416 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 TTI2Q6NXR4 508 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEBQ6S5H4 581 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DDX12PQ92771 950 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 SLC5A5Q92911 643 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KCND1Q9NSA2 647 aa20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KCNJ18B7U540 433 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MED24O75448 989 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 STK4Q13043 487 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KCNJ12Q14500 433 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CEP55Q53EZ4 464 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 TRIM47Q96LD4 638 aa20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PLA2G4BP0C869 781 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 FCER1AP12319 257 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PBX1P40424 430 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DYMQ7RTS9 669 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 RNF181Q9P0P0 153 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.36■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ALAS1P13196 640 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PPP2R5CQ13362 524 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 E9PMD0 336 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 NFIBO00712 420 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PSMD10O75832 226 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 BCRP11274 1271 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MUTP22033 750 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 OAZ1P54368 228 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 COASYQ13057 564 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DGKZQ13574 1117 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.35■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ARID2Q68CP9 1835 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEFA5A3E0 1075 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MEIS1O00470 390 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 VWA5AO00534 786 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEIP0CG38 1075 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 IDEP14735 1019 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 SLC12A3P55017 1021 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CENPPQ6IPU0 288 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEGQ6S5H5 508 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 GPBP1Q86WP2 473 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 CPXCR1Q8N123 301 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 UIMC1Q96RL1 719 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 DNM3Q9UQ16 869 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.34■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MYPNQ86TC9 1320 aa20.33■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TM2D2-201ENST00000397070 N4BP3O15049 544 aa20.33■□□□□ 0.84
TM2D2-201ENST00000397070 TEX33O43247 280 aa20.33■□□□□ 0.84
TM2D2-201ENST00000397070 COBLO75128 1261 aa20.33■□□□□ 0.84
TM2D2-201ENST00000397070 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
TM2D2-201ENST00000397070 CYP11B2P19099 503 aa20.33■□□□□ 0.84
TM2D2-201ENST00000397070 TERF1P54274 439 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms