RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF16Q5VV41 709 aa31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R18Q6NYC8 613 aa31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L6PQ6QN14 398 aa31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 GTF3C6Q969F1 213 aa31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP31.19■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 A6NJR5 290 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PIK3CDO00329 1044 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 CTDNEP1O95476 244 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 STXBP2Q15833 593 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 LY6KQ17RY6 165 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 FCHSD1Q86WN1 690 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 IWS1Q96ST2 819 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PXMP2Q9NR77 195 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa31.18■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ACRP10323 421 aa31.17■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ST3GAL1Q11201 340 aa31.17■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM22Q8IYM9 498 aa31.17■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 DTNBO60941 627 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 NR3C2P08235 984 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM199Q8N511 208 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL5Q93034 780 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 GUCD1Q96NT3 240 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 HIPK3Q9H422 1215 aa31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 CDKL5O76039 1030 aa31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM240Q5SV17 173 aa31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 RIC8AQ9NPQ8 531 aa31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 SMCO2A6NFE2 343 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 DEXIO95424 95 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP1Q07960 439 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 UBE2SQ16763 222 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF20Q3BBV1 942 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF697Q5TEC3 545 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 IL27Q8NEV9 243 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 AFG1LQ8WV93 481 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PDCD2LQ9BRP1 358 aa31.14■■■□□ 2.58
GNPTAB-202ENST00000392919 ST18O60284 1047 aa31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CCL23P55773 120 aa31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 IL31RAQ8NI17 732 aa31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 WNT8AQ9H1J5 351 aa31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa31.13■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 GH1P01241 217 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ADCY7P51828 1080 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF365Q70YC5 407 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 VPS54Q9P1Q0 977 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 FRMPD4Q14CM0 1322 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 STK36Q9NRP7 1315 aa31.12■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ESYT2A0FGR8 921 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 RGS20O76081 388 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP2C9P11712 490 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 PGM5Q15124 567 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM47CQ5HY64 1035 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 AIFM3Q96NN9 605 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ZMYND12Q9H0C1 365 aa31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 KPNA6O60684 536 aa31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP3P08254 477 aa31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 TEX2Q8IWB9 1127 aa31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 SEMA6BQ9H3T3 888 aa31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 IL23AQ9NPF7 189 aa31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS3O15072 1205 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 FDPSP14324 419 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CHMP4BP1P59074 171 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 RASIP1Q5U651 963 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 VSIG10LQ86VR7 867 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC83Q8IWF9 413 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 GLT8D2Q9H1C3 349 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 SH3GLB2Q9NR46 395 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.09■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 COL6A3P12111 3177 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 CLK2P49760 499 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 SCLYQ96I15 445 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-202ENST00000392919 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 JAK2O60674 1132 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC148Q8NFR7 591 aa31.07■■■□□ 2.56
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