RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.23■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.23■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 FIBPO43427 364 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 KPNA6O60684 536 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEXIO95424 95 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTDNEP1O95476 244 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 GGPS1O95749 300 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGB5P18084 799 aa25.22■■□□□ 1.63
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IGHV3-20-201ENST00000390606 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRO3102Q9H379 93 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 C6orf50Q9HD87 102 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.22■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 NECAB1Q8N987 351 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 AIFM3Q96NN9 605 aa25.21■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.2■■□□□ 1.63
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 SORBS3O60504 671 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDKL5O76039 1030 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLTBP09497 229 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNA11P29992 359 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 SREBF1P36956 1147 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAAP100Q0VG06 881 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NLRX1Q86UT6 975 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPTC7Q8NI37 304 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 GTF3C6Q969F1 213 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPRASP2Q96D09 838 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDF15Q99988 308 aa25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 STK36Q9NRP7 1315 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 DTNBO60941 627 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 JADE2Q9NQC1 790 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 ST3GAL1Q11201 340 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 KAT2BQ92831 832 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA33Q96N06 139 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.18■■□□□ 1.62
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IGHV3-20-201ENST00000390606 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.18■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA0355O15063 1070 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP9AO75110 1047 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD4P01730 458 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NLRP5P59047 1200 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGAP4P98171 946 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEDD9Q14511 834 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 DGKDQ16760 1214 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCTP2Q6DN12 878 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 METTL7BQ6UX53 244 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 BICD2Q8TD16 824 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBX21Q9UL17 535 aa25.17■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNA2P16389 499 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGB8P26012 769 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTMR1Q13613 665 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NPY5RQ15761 445 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDHR1Q96JP9 859 aa25.16■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAFGO15525 162 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPFIA4O75335 1185 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP3A4P08684 503 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP55Q53EZ4 464 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 LTBP2Q14767 1821 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 M0R2N6 131 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 B4GALT4O60513 344 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 BMP8BP34820 402 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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