RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384717.1

RNU6-520P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 520, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-520P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-520P-201ENST00000384717 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CRHR2Q13324 411 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CR1LQ2VPA4 569 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 LEXMQ3ZCV2 418 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 C9orf50Q5SZB4 431 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 LRRC55Q6ZSA7 311 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 Q6ZUG5 572 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 DAGLBQ8NCG7 672 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 RNF141Q8WVD5 230 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ELMO3Q96BJ8 720 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PCDH18Q9HCL0 1135 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PLA2G3Q9NZ20 509 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 FTSJ1Q9UET6 329 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CROTQ9UKG9 612 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PCDHA4Q9UN74 947 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A1W2PQ27 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A1W2PQ64 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A1W2PQC6 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A1W2PQD8 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A1W2PQJ5 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ANTXRLA6NF34 631 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRAF5O00463 557 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 MGST3O14880 152 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 WNT9AO14904 365 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 LPXNO60711 386 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 DDNO94850 711 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 GRK4P32298 578 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 STAT5AP42229 794 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 NR4A2P43354 598 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SLC6A11P48066 632 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SEC24CP53992 1094 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 DPYDQ12882 1025 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 MST1LQ2TV78 715 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SUSD1Q6UWL2 747 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TMC3Q7Z5M5 1100 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CUZD1Q86UP6 607 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PLPPR2Q96GM1 343 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 AP5S1Q9NUS5 200 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRPS1Q9UHF7 1281 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TLK1Q9UKI8 766 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 FAM221BA6H8Z2 402 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 FUCA1P04066 466 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PDGFAP04085 211 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PDE6AP16499 860 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TAP1Q03518 808 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SLC9A5Q14940 896 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 KIAA0319Q5VV43 1072 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PI16Q6UXB8 463 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ETV3LQ6ZN32 361 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 MIB1Q86YT6 1006 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 GALNT12Q8IXK2 581 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SUPT20HQ8NEM7 779 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SNX29Q8TEQ0 813 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 LINC00476Q8WZB0 136 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF524Q96C55 264 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 AJUBAQ96IF1 538 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 AK7Q96M32 723 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 HERPUD2Q9BSE4 406 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CDADC1Q9BWV3 514 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 CBX8Q9HC52 389 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ANLNQ9NQW6 1124 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 TMEM39AQ9NV64 488 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 BTBD3Q9Y2F9 522 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-520P-201ENST00000384717 ADAM10O14672 748 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRIM37O94972 964 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 ALPLP05186 524 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 NME2P22392 152 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 ITPKBP27987 946 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 TUBA4AP68366 448 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 RTP2Q5QGT7 225 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 PHF19Q5T6S3 580 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-520P-201ENST00000384717 CCDC62Q6P9F0 684 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms