RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
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PXDC1-202ENST00000380283 CAPS2Q9BXY5 557 aa29.27■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa29.27■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 TCP1P17987 556 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 C12orf60Q5U649 245 aa29.26■■■□□ 2.28
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PXDC1-202ENST00000380283 AK8Q96MA6 479 aa29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.26■■■□□ 2.28
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PXDC1-202ENST00000380283 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa29.26■■■□□ 2.28
PXDC1-202ENST00000380283 GRIN2DO15399 1336 aa29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 OPA1O60313 960 aa29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 EPHB4P54760 987 aa29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC96Q2M329 555 aa29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 C7orf25Q9BPX7 421 aa29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.273e-7■■■■■ 34.1
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PXDC1-202ENST00000380283 FKBP15Q5T1M5 1219 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 ALS2CLQ60I27 953 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 HDAC7Q8WUI4 952 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 USP40Q9NVE5 1235 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 CAVIN3Q969G5 261 aa29.25■■■□□ 2.27
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PXDC1-202ENST00000380283 OSBPL9Q96SU4 736 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa29.25■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 A6NNZ2 444 aa29.24■■■□□ 2.27
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PXDC1-202ENST00000380283 PDE4DQ08499 809 aa29.24■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 STK4Q13043 487 aa29.24■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 TUBB8Q3ZCM7 444 aa29.24■■■□□ 2.27
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PXDC1-202ENST00000380283 HYOU1Q9Y4L1 999 aa29.24■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 CCT5P48643 541 aa29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 SKOR1P84550 965 aa29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.23■■■□□ 2.27
PXDC1-202ENST00000380283 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
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PXDC1-202ENST00000380283 JDP2Q8WYK2 163 aa29.23■■■□□ 2.27
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PXDC1-202ENST00000380283 MOCS3O95396 460 aa29.2■■■□□ 2.26
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PXDC1-202ENST00000380283 GUCY2CP25092 1073 aa29.19■■■□□ 2.26
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PXDC1-202ENST00000380283 CNNM4Q6P4Q7 775 aa29.19■■■□□ 2.26
PXDC1-202ENST00000380283 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.19■■■□□ 2.26
PXDC1-202ENST00000380283 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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