RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FERMT2Q96AC1 680 aa17.56■□□□□ 0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRMS1Q9HCU9 246 aa17.56■□□□□ 0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPFIA4O75335 1185 aa17.51■□□□□ 0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 KRT2P35908 639 aa17.51■□□□□ 0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.51■□□□□ 0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ARVCFO00192 962 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS3O15072 1205 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 DTNBO60941 627 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP1P03956 469 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 RTP1P59025 263 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGA7Q13683 1181 aa17.49■□□□□ 0.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT40Q6A162 431 aa17.49■□□□□ 0.39
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