RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALG1Q9BT22 464 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL20A1Q9P218 1284 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD10Q14728 455 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCTN1Q2MV58 587 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPTC7Q8NI37 304 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 KAT14Q9H8E8 782 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 F2P00734 622 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP21A2P08686 494 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNMA1Q8ND90 353 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD320Q9NPF0 282 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 INSL6Q9Y581 213 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 TET1Q8NFU7 2136 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASC1Q6TDU7 716 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJD3Q8N144 294 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP4K1Q92918 833 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 EMSYQ7Z589 1322 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 HAS3O00219 553 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 LGR5O75473 907 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NR3C2P08235 984 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF286BP0CG31 522 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNA5P22460 613 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO11Q86XK2 927 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKS1AQ92625 1134 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PXMP2Q9NR77 195 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPFIA4O75335 1185 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 AMHP03971 560 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC45O75419 566 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFBP00751 764 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBTPS1Q14703 1052 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCOA7Q8NI08 942 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 WNT8BQ93098 351 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 E7EWF7 191 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPROQ16827 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERICH2A1L162 156 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRR33A8MZF0 331 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSPH10BP0C881 870 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 THPOP40225 353 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA33Q96N06 139 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAMD11Q96NU1 681 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALADP13716 330 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSD17B4P51659 736 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SERINC5Q86VE9 423 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 AMNQ9BXJ7 453 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRSQ13332 1948 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.2■■□□□ 1.14
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