RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PFKFB2O60825 505 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 STAM2O75886 525 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NEK4P51957 841 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 GNPTABQ3T906 1256 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DCDC2CA8MYV0 355 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FIBPO43427 364 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TGFB3P10600 412 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB5P18084 799 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LAMC2Q13753 1193 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ME3Q16798 604 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PPTC7Q8NI37 304 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 AIFM3Q96NN9 605 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 KIF2CQ99661 725 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM39AQ9NV64 488 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MROH7Q68CQ1 1323 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0355O15063 1070 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 B4GALT4O60513 344 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CTDNEP1O95476 244 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CD4P01730 458 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 AP3B2Q13367 1082 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD1Q15327 319 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NECAB1Q8N987 351 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 KAT2BQ92831 832 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 BADQ92934 168 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA33Q96N06 139 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 EHMT1Q9H9B1 1298 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TBX21Q9UL17 535 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ATP9AO75110 1047 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 DEXIO95424 95 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF286BP0CG31 522 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 BMP8BP34820 402 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SREBF1P36956 1147 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 DGKDQ16760 1214 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NLRX1Q86UT6 975 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GPRASP2Q96D09 838 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 C22orf23Q9BZE7 217 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TRPV6Q9H1D0 765 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf50Q9HD87 102 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TLR3O15455 904 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KPNA6O60684 536 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KCNA2P16389 499 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP4BP1P59074 171 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ST3GAL1Q11201 340 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NEDD9Q14511 834 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 METTL7BQ6UX53 244 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 JADE2Q9NQC1 790 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 RAG1P15918 1043 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GNA11P29992 359 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP4P98171 946 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SP4Q02446 784 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR1Q13613 665 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GTF3C6Q969F1 213 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 STK36Q9NRP7 1315 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CDKL5O76039 1030 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 F2P00734 622 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms