RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 STAM2O75886 525 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 CTDNEP1O95476 244 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 FAAP100Q0VG06 881 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 GNPTABQ3T906 1256 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 XRRA1Q6P2D8 792 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 RASGRP4Q8TDF6 673 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 GDF15Q99988 308 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa30.91■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 FIBPO43427 364 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 CLTBP09497 229 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ITGB8P26012 769 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ST3GAL1Q11201 340 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 HSDL1Q3SXM5 330 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa30.9■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 RBM25P49756 843 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 AP3B2Q13367 1082 aa30.89■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 LAMC2Q13753 1193 aa30.89■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf50Q9HD87 102 aa30.89■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.89■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 DEXIO95424 95 aa30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TGFB3P10600 412 aa30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 PPTC7Q8NI37 304 aa30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA33Q96N06 139 aa30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TOX2Q96NM4 488 aa30.88■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 FOSP01100 380 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 SREBF1P36956 1147 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TEX2Q8IWB9 1127 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 KAT2BQ92831 832 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C6Q969F1 213 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 GLT8D2Q9H1C3 349 aa30.87■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 DCDC2CA8MYV0 355 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 ATP9AO75110 1047 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF286BP0CG31 522 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 NLRX1Q86UT6 975 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 GPRASP2Q96D09 838 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 EHMT1Q9H9B1 1298 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TBX21Q9UL17 535 aa30.86■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CD4P01730 458 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF20Q3BBV1 942 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 JADE2Q9NQC1 790 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM39AQ9NV64 488 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CEP290O15078 2479 aa30.85■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 MROH7Q68CQ1 1323 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0355O15063 1070 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 B4GALT4O60513 344 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 KPNA6O60684 536 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 KCNA2P16389 499 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP5P59047 1200 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP4BP1P59074 171 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP4P98171 946 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 NPY5RQ15761 445 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 DGKDQ16760 1214 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.84■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 STK36Q9NRP7 1315 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 CDKL5O76039 1030 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 GNA11P29992 359 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 SP4Q02446 784 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR1Q13613 665 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 METTL7BQ6UX53 244 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 BADQ92934 168 aa30.83■■■□□ 2.53
TPGS1-201ENST00000359315 FDPSP14324 419 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 NEDD9Q14511 834 aa30.82■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 FAM47CQ5HY64 1035 aa30.82■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.82■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 JAK2O60674 1132 aa30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 ARP10275 920 aa30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 GPR20Q99678 358 aa30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 LTBP2Q14767 1821 aa30.81■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 FAM86B1E9PN63 330 aa30.8■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 EDIL3O43854 480 aa30.8■■■□□ 2.52
TPGS1-201ENST00000359315 F2P00734 622 aa30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms