RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 RIPK3Q9Y572 518 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MSH4O15457 936 aa22.55■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 STAMQ92783 540 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MAF1Q9H063 256 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 STK17AQ9UEE5 414 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 STAT3P40763 770 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 GRB10Q13322 594 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 CEP55Q53EZ4 464 aa22.54■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MB21D1Q8N884 522 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MTRQ99707 1265 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 STK24Q9Y6E0 443 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 FKBP1BP68106 108 aa22.54■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PNMA5Q96PV4 448 aa22.54■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 CASP1P29466 404 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PLS1Q14651 629 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 LBX2Q6XYB7 198 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 ACAD9Q9H845 621 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 RMND1Q9NWS8 449 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.29e-9■■□□□ 13.4
SUMO3-201ENST00000332859 CUL4BQ13620 913 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 ERMNQ8TAM6 284 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 UIMC1Q96RL1 719 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MEIS1O00470 390 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 AMPD3Q01432 767 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 HYIQ5T013 277 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC15Q8TF66 581 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINC1P01008 464 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 UBASH3AP57075 661 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 SNAPC2Q13487 334 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 TMC6Q7Z403 805 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 CHST13Q8NET6 341 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 SLC5A5Q92911 643 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 FANCLQ9NW38 375 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 SKILP12757 684 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 ATP1A3P13637 1013 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 CCZ1BP86790 482 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 MOGSQ13724 837 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 RMDN3Q96TC7 470 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 KCND1Q9NSA2 647 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 VAV3Q9UKW4 847 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 UQCRHP07919 91 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 BCRP11274 1271 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 OSBPP22059 807 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 GJA5P36382 358 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 SEMA3FQ13275 785 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 PGM5Q15124 567 aa22.5■■□□□ 1.19
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SUMO3-201ENST00000332859 SV2BQ7L1I2 683 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 IL31RAQ8NI17 732 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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SUMO3-201ENST00000332859 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 NRDCO43847 1150 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 HERVK_113P62684 666 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 ARID5BQ14865 1188 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-201ENST00000332859 FBXO40Q9UH90 709 aa22.49■■□□□ 1.19
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