RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 ASTN1O14525 1302 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 POTEMA6NI47 508 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 B4DLN1 442 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ARP10275 920 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CDC25AP30304 524 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 MAPK4P31152 587 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 MTMR1Q13613 665 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CAMK4Q16566 473 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PDILTQ8N807 584 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GPRASP2Q96D09 838 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CAPNS2Q96L46 248 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SDF4Q9BRK5 362 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CPA4Q9UI42 421 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 A0A087X0B3 334 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CABP7Q86V35 215 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PANK2Q9BZ23 570 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 MAFGO15525 162 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PSMD10O75832 226 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ALDH1A1P00352 501 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PGK2P07205 417 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 EDNRBP24530 442 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF445P59923 1031 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 STXBP2Q15833 593 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 LONRF3Q496Y0 759 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 C17orf99Q6UX52 265 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 NLRX1Q86UT6 975 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 IQUBQ8NA54 791 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CNNM3Q8NE01 707 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 UIMC1Q96RL1 719 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 RIT2Q99578 217 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 DISC1Q9NRI5 854 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 VAV3Q9UKW4 847 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SYCE3A1L190 88 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SLC26A4O43511 780 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 E2F4Q16254 413 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GPR142Q7Z601 462 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 DHX58Q96C10 678 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 STK24Q9Y6E0 443 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GAS7O60861 476 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KRT79Q5XKE5 535 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KANK3Q6NY19 840 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CDHR1Q96JP9 859 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CA12O43570 354 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SLFN14P0C7P3 912 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ADORA2AP29274 412 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CRHR2Q13324 411 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R5CQ13362 524 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GNPTABQ3T906 1256 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CALML4Q96GE6 196 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 FGD4Q96M96 766 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 PDE4DQ08499 809 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 GRB14Q14449 540 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ERMNQ8TAM6 284 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 AOC2O75106 756 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 RGS20O76081 388 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 STAT6P42226 847 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC71-201ENST00000321895 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC71-201ENST00000321895 MORC4Q8TE76 937 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC71-201ENST00000321895 CUEDC2Q9H467 287 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms