RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

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Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 50.8
ZNF559-201ENST00000317221 LPIN2Q92539 896 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SHISA4Q96DD7 197 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TSKSQ9UJT2 592 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CFAP73A6NFT4 308 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PJA2O43164 708 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PRDM1O75626 825 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KIF4AO95239 1232 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FESP07332 822 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FLT3P36888 993 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ERVK-9P63128 1117 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EHHADHQ08426 723 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 WTAPQ15007 396 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 IL17AQ16552 155 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GNPTABQ3T906 1256 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FIGNQ5HY92 759 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TTI2Q6NXR4 508 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 C5P01031 1676 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 STXBP3O00186 592 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ASAP2O43150 1006 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 AHCYL1O43865 530 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SMIM24O75264 130 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CIAO1O76071 339 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FTCDO95954 541 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NEFHP12036 1026 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ATP4AP20648 1035 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ECHS1P30084 290 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ADD2P35612 726 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KCNJ2P63252 427 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TNNC1P63316 161 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PSMD2Q13200 908 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CUL1Q13616 776 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MIIPQ5JXC2 388 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TTC38Q5R3I4 469 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 RRAGAQ7L523 313 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TMTC2Q8N394 836 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 USP38Q8NB14 1042 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 CENPTQ96BT3 561 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 EPHB6O15197 1021 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PALMO75781 387 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 GLI3P10071 1580 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ALADP13716 330 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MCM7P33993 719 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 STAT6P42226 847 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ABL2P42684 1182 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 MAP3K12Q12852 859 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ITPK1Q13572 414 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 PKN1Q16512 942 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 KRT71Q3SY84 523 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 ARMC3Q5W041 872 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF559-201ENST00000317221 TNS2Q63HR2 1409 aa6.28□□□□□ -1.4
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