RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 MB21D1Q8N884 522 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 POLR2MP0CAP2 368 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CASP14P31944 242 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC63Q05C16 580 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 SYCP1Q15431 976 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 GJA10Q969M2 543 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 KIFC2Q96AC6 838 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 IDEP14735 1019 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 FAM86B1E9PN63 330 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 PLA2G4BP0C869 781 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF76P36508 570 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC174Q6PII3 467 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 GPC2Q8N158 579 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.58■□□□□ 0.89
HCLS1-201ENST00000314583 POTEB3A0JP26 581 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 POTECB2RU33 542 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 COASYQ13057 564 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 POTEBQ6S5H4 581 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 TSG101Q99816 390 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 RPA1P27694 616 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 LPAR1Q92633 364 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FEZ1Q99689 392 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 PANK4Q9NVE7 773 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 E9PMD0 336 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MSH4O15457 936 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MED24O75448 989 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 CFBP00751 764 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC175P0C221 793 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 HPS3Q969F9 1004 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 NUP58Q9BVL2 599 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 KIF20AO95235 890 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 STAT3P40763 770 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 GPBP1Q86WP2 473 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 RETREG2Q8NC44 543 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 IQCDQ96DY2 449 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 MAP7D2Q96T17 732 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 DCAF15Q66K64 600 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 VAV3Q9UKW4 847 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 CYP11B2P19099 503 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 INPP5BP32019 993 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 SLC12A3P55017 1021 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 LDHDQ86WU2 507 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 DNM3Q9UQ16 869 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 HOOK2Q96ED9 719 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-201ENST00000314583 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms