RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa13.55□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 OXER1Q8TDS5 423 aa13.55□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TSPY26PQ9H489 355 aa13.55□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13.55□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 STAM2O75886 525 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP4P98171 946 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 NR5A1Q13285 461 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 RBSNQ9H1K0 784 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.54□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 MSCO60682 206 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ADCYAP1R1P41586 468 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 GNPTABQ3T906 1256 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 SCFD2Q8WU76 684 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 BTBD18B2RXH4 712 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 RGS20O76081 388 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TNFAIP2Q03169 654 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TTLL4Q14679 1199 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ANO1Q5XXA6 986 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TBCKQ8TEA7 893 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 TNFRSF25Q93038 417 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 DEFB118Q96PH6 123 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.53□□□□□ -0.24
C16orf46-201ENST00000299578 ADCY6O43306 1168 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GJB1P08034 283 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CYP3A4P08684 503 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 RARBP10826 455 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SMPD1P17405 629 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF76P36508 570 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 INF2Q27J81 1249 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.52□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ARIH2O95376 493 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ITGB5P18084 799 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 UVSSAQ2YD98 709 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CEP55Q53EZ4 464 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LHX8Q68G74 356 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NLRX1Q86UT6 975 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GPRASP2Q96D09 838 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.51□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FAM205CA6NFA0 338 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 KIF28PB7ZC32 967 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 USP11P51784 963 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MTMR1Q13613 665 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM63BQ5T3F8 832 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 BRAPQ7Z569 592 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NEK8Q86SG6 692 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 JADE2Q9NQC1 790 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FAM86B1E9PN63 330 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SGPL1O95470 568 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TGFB3P10600 412 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ICAM3P32942 547 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CIITAP33076 1130 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GJA8P48165 433 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms