RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 USP40Q9NVE5 1235 aa22.3■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TMEM260Q9NX78 707 aa22.3■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GNGT1P63211 74 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 STK4Q13043 487 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 MYH4Q9Y623 1939 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 SNHG28P0DPA3 235 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 FCER1AP12319 257 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 CCNE1P24864 410 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 P2RX5Q93086 422 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 SHTN1A0MZ66 631 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TECP42680 631 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 DNM2P50570 870 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 PDE4DQ08499 809 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 CENPHQ9H3R5 247 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 EXOC1Q9NV70 894 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 SWAP70Q9UH65 585 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 RASSF10A6NK89 507 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 ASIC1P78348 528 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 AMPD2Q01433 879 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 COA7Q96BR5 231 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TTLL1O95922 423 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 SHMT1P34896 483 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 MEA1Q16626 185 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 WDR93Q6P2C0 686 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 HINFPQ9BQA5 517 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS6-201ENST00000299238 KIF3CO14782 793 aa22.27■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ADCY7P51828 1080 aa22.27■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.27■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MTMR9Q96QG7 549 aa22.27■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 COG1Q8WTW3 980 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 POLD4Q9HCU8 107 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 BICDL2A1A5D9 508 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 EDIL3O43854 480 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MYBL2P10244 700 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ERCC3P19447 782 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PDE6BP35913 854 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 HERVK_113P62684 666 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CEP57Q86XR8 500 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 FSBPO95073 299 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ALDH1B1P30837 517 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ZNF543Q08ER8 600 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MIIPQ5JXC2 388 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TEKT1Q969V4 418 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 KLC4Q9NSK0 619 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SRGAP2O75044 1071 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 GRB10Q13322 594 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 KLHL33A6NCF5 533 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 G3V3G9 751 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PPFIA1Q13136 1202 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 AKT1S1Q96B36 256 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SIPA1L1O43166 1804 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 RTN2O75298 545 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TXKP42681 527 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 AMPD3Q01432 767 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 NFIAQ12857 509 aa22.24■■□□□ 1.15
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