RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 PI16Q6UXB8 463 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 IL17REQ8NFR9 667 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PHEXP78562 749 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM58Q8NG06 486 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PMLP29590 882 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TSKSQ9UJT2 592 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MGEA5O60502 916 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZBTB7AO95365 584 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 GCNT4Q9P109 453 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 XDHP47989 1333 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CHL1O00533 1208 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CCNA1P78396 465 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MFAP3P55082 362 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MOCS3O95396 460 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 KRT1P04264 644 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MORC4Q8TE76 937 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 FAM196BA6NMK8 535 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZBBXA8MT70 800 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MYBP10242 640 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 NT5C1BQ96P26 610 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 GBP5Q96PP8 586 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.61■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MYO1FO00160 1098 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PSMD2Q13200 908 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC38Q502W7 563 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 AFG1LQ8WV93 481 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CDKL2Q92772 493 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 VGLL3A8MV65 326 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SGO2Q562F6 1265 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 AMNQ9BXJ7 453 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PIK3R2O00459 728 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 GPC4O75487 556 aa15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 MCF2LO15068 1137 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 FTCDO95954 541 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 AOC3Q16853 763 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 C10orf76Q5T2E6 689 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ASPHQ12797 758 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 APOEP02649 317 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 RBL2Q08999 1139 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 ACCSLQ4AC99 568 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 SUFUQ9UMX1 484 aa15.59■□□□□ 0.09
SORCS1-201ENST00000263054 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms