RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 POTEFA5A3E0 1075 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 POTEIP0CG38 1075 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 POTEGQ6S5H5 508 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 ERMNQ8TAM6 284 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 FZD1Q9UP38 647 aa26.8■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 RBL2Q08999 1139 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 HOOK2Q96ED9 719 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 VCAM1P19320 739 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 RPA1P27694 616 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SPP2Q13103 211 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 CEP135Q66GS9 1140 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMD2Q13200 908 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 CENPPQ6IPU0 288 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 LMNB1P20700 586 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 HSD17B4P51659 736 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 COASYQ13057 564 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 GPBP1Q86WP2 473 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 CPXCR1Q8N123 301 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 GPC2Q8N158 579 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 WRNIP1Q96S55 665 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 MEIS1O00470 390 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 FLOT1O75955 427 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 EPS15P42566 896 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMC6P62333 389 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PTPN14Q15678 1187 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 PANK4Q9NVE7 773 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPAN13-201ENST00000262067 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 EML1O00423 815 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 NFIBO00712 420 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 UQCRHP07919 91 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 TPM2P07951 284 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CYP11B2P19099 503 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC12A3P55017 1021 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 GGA3Q9NZ52 723 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 STK24Q9Y6E0 443 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 STX10O60499 249 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 USP14P54578 494 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 UBXN1Q04323 297 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRC41Q15345 812 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CEP55Q53EZ4 464 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ARHGAP6O43182 974 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PTPRAP18433 802 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ARSHQ5FYA8 562 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC5A5Q92911 643 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 COL20A1Q9P218 1284 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMD10O75832 226 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 GYPCP04921 128 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 ALAS1P13196 640 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CASP14P31944 242 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 BACE1P56817 501 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PANX2Q96RD6 677 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PICK1Q9NRD5 415 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 DNM3Q9UQ16 869 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 UTRNP46939 3433 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 LGALS16A8MUM7 142 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CYP4A11Q02928 519 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN13-201ENST00000262067 MB21D1Q8N884 522 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms