RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CSNK1G2-201ENST00000255641 PDXDC1Q6P996 788 aa23.41■■□□□ 1.34
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.39■■□□□ 1.34
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNK3O14649 394 aa23.38■■□□□ 1.33
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CSNK1G2-201ENST00000255641 PDHBP11177 359 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACTN1P12814 892 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIK5Q16478 980 aa23.37■■□□□ 1.33
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CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.36■■□□□ 1.33
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ECM1Q16610 540 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRM4Q14833 912 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 18.9
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.35■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.35■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSD17B3P37058 310 aa23.35■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.35■■□□□ 1.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX12PQ92771 950 aa23.35■■□□□ 1.33
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