RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRNP2-201ENST00000228515 STK32BQ9NY57 414 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRNP2-201ENST00000228515 P4HA1P13674 534 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 THAP9Q9H5L6 903 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PLA2G4BP0C869 781 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MFAP3P55082 362 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 IL9RQ01113 521 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RPS6KA2Q15349 733 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CSRNP1Q96S65 589 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 HESX1Q9UBX0 185 aa16.02■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 XDHP47989 1333 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PLA2R1Q13018 1463 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SFI1A8K8P3 1242 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SGK1O00141 431 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CAPN9O14815 690 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MECOMQ03112 1051 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 HLFQ16534 295 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RASIP1Q5U651 963 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FMO2Q99518 471 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 COX16Q9P0S2 106 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FOXN1O15353 648 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 TRIM50Q86XT4 487 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PIGBQ92521 554 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 NACA2Q9H009 215 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 USP21Q9UK80 565 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 HEG1Q9ULI3 1381 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 INHBAP08476 426 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ARHGAP4P98171 946 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RNF169Q8NCN4 708 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP27B1O15528 508 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 OPHN1O60890 802 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 TNNC2P02585 160 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CDC27P30260 824 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RCN2Q14257 317 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 TMCO4Q5TGY1 634 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SUSD4Q5VX71 490 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 BBOF1Q8ND07 529 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GSDMBQ8TAX9 411 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MYO1CO00159 1063 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SERPING1P05155 500 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 BPIFB4P59827 614 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GABPAQ06546 454 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SYNMO15061 1565 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ECEL1O95672 775 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PDE1BQ01064 536 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ANO3Q9BYT9 981 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 KANSL2Q9H9L4 492 aa16■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP2D6P10635 497 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PRDX5P30044 214 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PIK3CAP42336 1068 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PRCPP42785 496 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 NEK9Q8TD19 979 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 RASGRF2O14827 1237 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 APBA3O96018 575 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 PDE6BP35913 854 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 DYNLT1P63172 113 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 NME8Q8N427 588 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ATP7BP35670 1465 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 POTEMA6NI47 508 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MXI1P50539 228 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 ESYT3A0FGR9 886 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FGGP02679 453 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 EMBQ6PCB8 327 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 DGKHQ86XP1 1220 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRNP2-201ENST00000228515 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms