RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.98■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 A0A1B0GVL5 298 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 B4DLN1 442 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 STAM2O75886 525 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 PSMC4P43686 418 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 FCGRTP55899 365 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 MAP2K5Q13163 448 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 USP49Q70CQ1 688 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 TRIM47Q96LD4 638 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.97■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 LIG1P18858 919 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 CMA1P23946 247 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 CAP1Q01518 475 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 RESP18Q5W5W9 173 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 NLRX1Q86UT6 975 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 MAML3Q96JK9 1138 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 FAM20AQ96MK3 541 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 POTEMA6NI47 508 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 PP2D1A8MPX8 630 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 CDC25AP30304 524 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 SEMA3FQ13275 785 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 ARMCX2Q7L311 632 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 SLC5A5Q92911 643 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 GPRASP2Q96D09 838 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 EPSTI1Q96J88 318 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 WDR81Q562E7 1941 aa25.95■■□□□ 1.75
USF2-201ENST00000222305 ASB14A6NK59 587 aa25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 MORC4Q8TE76 937 aa25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 USP6NLQ92738 828 aa25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 GJD2Q9UKL4 321 aa25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 PFKFB1P16118 471 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 GNPTABQ3T906 1256 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.94■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 GPR25O00155 361 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 TRAK2O60296 914 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 ATP9AO75110 1047 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 PSMD10O75832 226 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 MBD3O95983 291 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CYP2B6P20813 491 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 NDUFA8P51970 172 aa25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 RGS2P41220 211 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 KIF22Q14807 665 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 WBP1LQ9NX94 342 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 VAV3Q9UKW4 847 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 GAS7O60861 476 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 NR1I2O75469 434 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 HOXC6P09630 235 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 RAB34Q9BZG1 259 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 GABRQQ9UN88 632 aa25.92■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 MAFGO15525 162 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 PDIA5Q14554 519 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CCL14Q16627 93 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 AK8Q96MA6 479 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 APBA2Q99767 749 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 TINF2Q9BSI4 451 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 HPSEQ9Y251 543 aa25.91■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 ICAM3P32942 547 aa25.9■■□□□ 1.74
USF2-201ENST00000222305 CDHR1Q96JP9 859 aa25.9■■□□□ 1.74
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