RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 VWCEQ96DN2 955 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 THEGQ9P2T0 379 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 TNFRSF10AO00220 468 aa25.06■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 MMP3P08254 477 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP1Q07960 439 aa25.06■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 SCLYQ96I15 445 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.05■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 IGFBP4P22692 258 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 RABGGTBP53611 331 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 LAMC2Q13753 1193 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 DGKDQ16760 1214 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 RTN1Q16799 776 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 GNPTABQ3T906 1256 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.04■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.04■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.03■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 PIK3CDO00329 1044 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 STAM2O75886 525 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 RGS20O76081 388 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 TGFB3P10600 412 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 CYP2C9P11712 490 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 MYOGP15173 224 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 PPTC7Q8NI37 304 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.02■■□□□ 1.6
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NME4-201ENST00000219479 SORBS3O60504 671 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 GGPS1O95749 300 aa25.01■■□□□ 1.59
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NME4-201ENST00000219479 PSMA5P28066 241 aa25.01■■□□□ 1.59
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NME4-201ENST00000219479 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 KCNB2Q92953 911 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 SPATA33Q96N06 139 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 XIRP2A4UGR9 3374 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 MEIS2O14770 477 aa25■■□□□ 1.59
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NME4-201ENST00000219479 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 KATNAL1Q9BW62 490 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PFKMP08237 780 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 11.1
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NME4-201ENST00000219479 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 Q6ZUG5 572 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 TET1Q8NFU7 2136 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 ZNF286BP0CG31 522 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 NAPAP54920 295 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 C7orf31Q8N865 590 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 BRF1Q92994 677 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NME4-201ENST00000219479 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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