RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217971.7

PGRMC1-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC1, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1-201ENST00000217971 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.01■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MEIS1O00470 390 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PFKFB1P16118 471 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ITGB5P18084 799 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TECP42680 631 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 NDUFA8P51970 172 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 USP49Q70CQ1 688 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 VSIG10LQ86VR7 867 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ENGASEQ8NFI3 743 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 GJA10Q969M2 543 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 HPSEQ9Y251 543 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MSH4O15457 936 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MARCH6O60337 910 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PGK2P07205 417 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CCND2P30279 289 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 XRRA1Q6P2D8 792 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SLFN12Q8IYM2 578 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 EPSTI1Q96J88 318 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM20AQ96MK3 541 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 IWS1Q96ST2 819 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 DACT1Q9NYF0 836 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 STRNO43815 780 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MAPK4P31152 587 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PRMT2P55345 433 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 GPR142Q7Z601 462 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 UIMC1Q96RL1 719 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 JADE2Q9NQC1 790 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.99■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 AK8Q96MA6 479 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MCM3APO60318 1980 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ARP10275 920 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ADORA2AP29274 412 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CDC25AP30304 524 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SYKP43405 635 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PDIA5Q14554 519 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FGD4Q96M96 766 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.98■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PP2D1A8MPX8 630 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 STAM2O75886 525 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ZNF202O95125 648 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 EDNRBP24530 442 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CTGFP29279 349 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 CLCN1P35523 988 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PSMC4P43686 418 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 RGS19P49795 217 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 FCGRTP55899 365 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 MTMR1Q13613 665 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 TRIM47Q96LD4 638 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 RAB34Q9BZG1 259 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.97■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 POTEMA6NI47 508 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 GRB14Q14449 540 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 STXBP2Q15833 593 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 SLC5A5Q92911 643 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ARMC5Q96C12 935 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.96■□□□□ 0.15
PGRMC1-201ENST00000217971 A0A087X0B3 334 aa15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 KINO60870 393 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 COBLO75128 1261 aa15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 RGS20O76081 388 aa15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 HOXD10P28358 340 aa15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 SOX10P56693 466 aa15.96■□□□□ 0.14
PGRMC1-201ENST00000217971 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms