RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FastkQ9JIX9 511 aa3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Capn15Q9JLG8 1095 aa3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 GgcxQ9QYC7 757 aa3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 HgfacQ9R098 653 aa3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Apobec2Q9WV35 224 aa3.08□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1436A0PK57 315 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Itga8A2ARA8 1062 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc28a1E9PXX9 648 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Xkr6E9Q6C8 638 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm11397F6V5V4 377 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AampJ3QN89 436 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atp8a1P70704 1164 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Itga4Q00651 1039 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ItkQ03526 625 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sox9Q04887 507 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dact3Q0PHV7 610 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fads2p1Q0VAX3 487 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Perm1Q149B8 807 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dhrs11Q3U0B3 260 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rasip1Q3U0S6 961 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 GpkowQ56A08 488 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 E2f8Q58FA4 860 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mfsd3Q5U419 412 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adam6bQ6IMH7 756 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ddx42Q810A7 929 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rgs13Q8K443 158 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MfrpQ8K480 584 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ablim1Q8K4G5 861 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Crtac1Q8R555 646 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rbm43Q99J64 343 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 March2Q99M02 246 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dcp2Q9CYC6 422 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q9D9S1 216 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tbx18Q9EPZ6 613 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zbp1Q9QY24 411 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Aloxe3Q9WV07 711 aa3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Veph1A1A535 833 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CercamA3KGW5 592 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm28042B7ZCM9 1014 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppfia4B8QI36 1187 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 C130060K24RikG3UWA8 416 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smpd2O70572 419 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Aff1O88573 1216 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spsb2O88838 264 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zfy1P10925 782 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc4a3P16283 1227 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pde6aP27664 859 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vav1P27870 845 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppm1bP36993 390 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gdf6P43028 454 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stat6P52633 837 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stra8P70278 393 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cry1P97784 606 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Siah1bQ06985 282 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cd244Q07763 397 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Oxr1Q4KMM3 866 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 WhammQ571B6 793 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MypnQ5DTJ9 1315 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm21093Q6GQS8 569 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rxfp1Q6R6I7 758 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tas2r104Q7M723 302 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1437Q7TQR7 312 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Saxo2Q8BQB6 394 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Exosc6Q8BTW3 273 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ubr7Q8BU04 425 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bcas3Q8CCN5 928 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r208Q8R275 308 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ndc1Q8VCB1 673 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mylk2Q8VCR8 613 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc12a9Q99MR3 914 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tdrd1Q99MV1 1172 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 KelQ9EQF2 713 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rab27aQ9ERI2 221 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Klrc3Q9QXN7 221 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Plod3Q9R0E1 741 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Oaz3Q9R109 243 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp18Q9WTV6 368 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slfn14V9GXG1 899 aa3.06□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AunipE9Q6Z5 340 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm45837F7D3W5 961 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Taf4bG5E8Z2 855 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Birc3O08863 600 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cer1O55233 272 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 DnttP09838 530 aa3.05□□□□□ -1.92
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Myd88P22366 296 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms