RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D5Q92609 795 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LMCD1Q9NZU5 365 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC6Q9UBN7 1215 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TRANK1O15050 2925 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB11O95342 1321 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CKBP12277 381 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GPNMBQ14956 572 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D10CQ8IV04 446 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
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CAPNS1-217ENST00000629983 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa32.02■■■□□ 2.72
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CAPNS1-217ENST00000629983 PSEN2P49810 448 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 MCF2L2Q86YR7 1114 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ESR2Q92731 530 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RMDN3Q96TC7 470 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 KATNAL1Q9BW62 490 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYM6O95789 1325 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB5O95377 273 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL10P02778 98 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PCP11498 1178 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
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CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF16Q5VV41 709 aa32■■■□□ 2.71
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CAPNS1-217ENST00000629983 IKBKEQ14164 716 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD10Q14728 455 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTN1Q2MV58 587 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 IWS1Q96ST2 819 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SUGCTQ9HAC7 445 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 COL20A1Q9P218 1284 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC171Q6TFL3 1326 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01553A4QN01 128 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB14O75071 495 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF286BP0CG31 522 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE1AP54750 535 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-21P61565 698 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RBL2Q08999 1139 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PTK7Q13308 1070 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA1Q8ND90 353 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TET1Q8NFU7 2136 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT14Q9H8E8 782 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NEDD4P46934 1319 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0753Q2KHM9 967 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRF4Q8IZF3 695 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPR37L1O60883 481 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMC2Q13753 1193 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF618Q5T7W0 954 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCA1Q86XH1 822 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO11Q86XK2 927 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 VAT1LQ9HCJ6 419 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SORBS3O60504 671 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA5P22460 613 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 QRICH1Q2TAL8 776 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO22Q8NEZ5 403 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PPTC7Q8NI37 304 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RILPL2Q969X0 211 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF213O14771 459 aa31.93■■■□□ 2.7
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CAPNS1-217ENST00000629983 F2P00734 622 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CFBP00751 764 aa31.93■■■□□ 2.7
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC178Q5BJE1 867 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CD320Q9NPF0 282 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM4AO75164 1064 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LGR5O75473 907 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 NR3C2P08235 984 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPRV1Q53RT3 343 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOCDQ8IZQ8 938 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT8BQ93098 351 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf16Q9NQ32 467 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PXMP2Q9NR77 195 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 AMHP03971 560 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf80Q9BSJ5 609 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 INSL6Q9Y581 213 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4K2BG5E9Z4 385 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LEXMQ3ZCV2 418 aa31.9■■■□□ 2.7
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