RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PNMA1Q8ND90 353 aa14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SHISA4Q96DD7 197 aa14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FBXO3Q9UK99 471 aa14.58□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PAX7P23759 505 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ADCY1Q08828 1119 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CNPY4Q8N129 248 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ABCB4P21439 1286 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KLRC1P26715 233 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TLR10Q9BXR5 811 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 AMACRQ9UHK6 382 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PIK3C2AO00443 1686 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DAPK3O43293 454 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PPP2R5BQ15173 497 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PEX26Q7Z412 305 aa14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KIF4AO95239 1232 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TROAPQ12815 778 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TEX11Q8IYF3 940 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SH3GL2Q99962 352 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ABCC12Q96J65 1359 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM107AO95990 144 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 HVCN1Q96D96 273 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIM9Q9C026 710 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 USP17L3A6NCW0 530 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 USP17L4A6NCW7 530 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 OR52Z1P0C646 297 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ASIC2Q16515 512 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MAN2A1Q16706 1144 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.56□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC63Q8NA47 563 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CHRNDQ07001 517 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 DONSONQ9NYP3 566 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 IL2RBP14784 551 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 COPB2P35606 906 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TRAPPC10P48553 1259 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KRT79Q5XKE5 535 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 SMCO2A6NFE2 343 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 CSF1RP07333 972 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 USP17L8P0C7I0 530 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 WHAMMQ8TF30 809 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 GJA10Q969M2 543 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 VCPKMTQ9H867 229 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 POTEMA6NI47 508 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 HSD17B3P37058 310 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 PLTPP55058 493 aa14.54□□□□□ -0.08
CYFIP1-211ENST00000619348 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms