RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	TOX2	Q96NM4	488 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	GDF15	Q99988	308 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	RGS20	O76081	388 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	COPS5	Q92905	334 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056	IL17RA	Q96F46	866 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PMS1-220	ENST00000618056		A6NJR5	290 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	CDK7	P50613	346 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	LAMA3	Q16787	3333 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	STAM2	O75886	525 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	ARVCF	O00192	962 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	GH1	P01241	217 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	BMP8B	P34820	402 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	LY6K	Q17RY6	165 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	BARHL2	Q9NY43	387 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	NTRK3	Q16288	839 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	STXBP3	O00186	592 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	CLTB	P09497	229 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	TGFB3	P10600	412 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	NAPA	P54920	295 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	KPNA6	O60684	536 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056		A0A1W2PPC1	479 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	SEC24B	O95487	1268 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	IFNAR1	P17181	557 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	ITGA7	Q13683	1181 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	UBE2S	Q16763	222 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	GRIN2D	O15399	1336 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	SCG2	P13521	617 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PMS1-220	ENST00000618056	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	KIAA0355	O15063	1070 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	MYL3	P08590	195 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	ICAM3	P32942	547 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	LAMC2	Q13753	1193 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PKN1	Q16512	942 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	AFG1L	Q8WV93	481 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	ADCY7	P51828	1080 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	SMCO2	A6NFE2	343 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	MMP3	P08254	477 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PSMC6	P62333	389 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PHKB	Q93100	1093 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PMS1-220	ENST00000618056	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16

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