RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MAP4K1	Q92918	833 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	UIMC1	Q96RL1	719 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ABCB11	O95342	1321 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LRMP	Q12912	555 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	APOA5	Q6Q788	366 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PARVG	Q9HBI0	331 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TLDC2	A0PJX2	215 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	HSPA1L	P34931	641 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DENND2C	Q68D51	928 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649		Q3C1V9	767 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LCORL	Q8N3X6	602 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KRT12	Q99456	494 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PTH1R	Q03431	593 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TXNRD1	Q16881	649 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25	3e-6	■■■■■ 51.5
ACACA-240	ENST00000617649	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CPD	O75976	1380 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CEP104	O60308	925 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FCER1A	P12319	257 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CYP4A11	Q02928	519 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NEDD9	Q14511	834 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MMP19	Q99542	508 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	LIFR	P42702	1097 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	DGKH	Q86XP1	1220 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	IQGAP1	P46940	1657 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF75D	P51815	510 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TBCK	Q8TEA7	893 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	GSDMA	Q96QA5	445 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	UTY	O14607	1347 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649		H7C1W4	665 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PHKA2	P46019	1235 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	KYAT1	Q16773	422 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NBPF11	Q86T75	865 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PALM2	Q8IXS6	379 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NME8	Q8N427	588 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	ESYT2	A0FGR8	921 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	RCAN1	P53805	252 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ACACA-240	ENST00000617649	C7orf31	Q8N865	590 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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