RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 GABRQQ9UN88 632 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 HOXC6P09630 235 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MEIS1O00470 390 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 FCGRTP55899 365 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 KRT85P78386 507 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 SLC39A14Q15043 492 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 POTEDQ86YR6 584 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MAML3Q96JK9 1138 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 IWS1Q96ST2 819 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.78■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 YEATS4O95619 227 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 PTGDRQ13258 359 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 SEMA3FQ13275 785 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 IL17AQ16552 155 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 Q4G0T1 1027 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 JMYQ8N9B5 988 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR9Q96QG7 549 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CSAG3-202ENST00000617158 FIBPO43427 364 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ARP10275 920 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CCND2P30279 289 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CEP55Q53EZ4 464 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 DPP9Q86TI2 863 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 HAS1Q92839 578 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 GJA10Q969M2 543 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CFAP45Q9UL16 551 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 FKTNO75072 461 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 GRIN1Q05586 938 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CCL14Q16627 93 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PRR16Q569H4 304 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 UIMC1Q96RL1 719 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 KATNBL1Q9H079 304 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 JADE2Q9NQC1 790 aa23.75■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 NEMFO60524 1076 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CYP2B6P20813 491 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PRKCZQ05513 592 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SPTLC2O15270 562 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 MSH4O15457 936 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF76P36508 570 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 RGS2P41220 211 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 FLT3LGP49771 235 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 STK38Q15208 465 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 STXBP2Q15833 593 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ARMCX2Q7L311 632 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA32Q96LK8 384 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ASB14A6NK59 587 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PDE4DQ08499 809 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 APBA2Q99767 749 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ATP9AO75110 1047 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 OR52Z1P0C646 297 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 KIF22Q14807 665 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CALCRLQ16602 461 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 TINF2Q9BSI4 451 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 SRRDQ9UH36 339 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAG3-202ENST00000617158 ELP1O95163 1332 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms