RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 EFCAB14O75071 495 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 CALML3P27482 149 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBL2Q08999 1139 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 SESTD1Q86VW0 696 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 BANK1Q8NDB2 785 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRSS33Q8NF86 280 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 MTMR7Q9Y216 660 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPAA1O43292 621 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 ST18O60284 1047 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARIH2O95376 493 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 EPC2Q52LR7 807 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 APPBP2Q92624 585 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPATCH3Q96I76 525 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 STX8Q9UNK0 236 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-209ENST00000616395 EDNRBP24530 442 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC16A2P36021 539 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDE4BQ07343 736 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL19A1Q14993 1142 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SKAP1Q86WV1 359 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 AFG1LQ8WV93 481 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 KAT2BQ92831 832 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIOO75962 3097 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 USP34Q70CQ2 3546 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNAT2P19087 354 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 IER5LQ5T953 404 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CASC1Q6TDU7 716 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLDND1Q9NY35 253 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 M0R2C6 588 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 NMT2O60551 498 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP3P08254 477 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MX1P20591 662 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPM6BQ13491 265 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MBTPS1Q14703 1052 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC96Q2M329 555 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 H3BNC9 293 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 WNT8BQ93098 351 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SAMD11Q96NU1 681 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 LGR5O75473 907 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 AMHP03971 560 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 LTBRP36941 435 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN5P54829 565 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 C5orf42Q9H799 3197 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPARAQ07869 468 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP1Q07960 439 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTK7Q13308 1070 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLUL1Q15846 466 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPAINQ86UA6 219 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF135Q8IUD6 432 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 C7orf31Q8N865 590 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 DNERQ8NFT8 737 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCAF4Q8WV16 495 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 EDAQ92838 391 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSPY2A6NKD2 308 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 LY6KQ17RY6 165 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 C8orf34Q49A92 452 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHST3Q7LGC8 479 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms