RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SMARCA1P28370 1054 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CCL23P55773 120 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMC2Q13753 1193 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 KRT32Q14532 448 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 PGM5Q15124 567 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 DGKDQ16760 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 MYH6P13533 1939 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 ACRP10323 421 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 GHRHRQ02643 423 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MICU3Q86XE3 530 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 12.6
ANKRD54-211ENST00000609454 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMA3Q16787 3333 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MMP3P08254 477 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGAP1Q07960 439 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 GNPTABQ3T906 1256 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 RETREG2Q8NC44 543 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 IL23AQ9NPF7 189 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SORBS3O60504 671 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 FGBP02675 491 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP2C9P11712 490 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM240Q5SV17 173 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF365Q70YC5 407 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCBQ8NB91 859 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 GGPS1O95749 300 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 TGFB3P10600 412 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 C7orf31Q8N865 590 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PPTC7Q8NI37 304 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA33Q96N06 139 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ALG1Q9BT22 464 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB43O43298 467 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 STAM2O75886 525 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 BFSP2Q13515 415 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 IL31RAQ8NI17 732 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SCLYQ96I15 445 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBBXA8MT70 800 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 PTGISQ16647 500 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 REC8O95072 547 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 PSEN2P49810 448 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 RTN1Q16799 776 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 APOA5Q6Q788 366 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 NLRX1Q86UT6 975 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 RASEFQ8IZ41 740 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms