RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 TTC14Q96N46 770 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NEDD4P46934 1319 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RAD50Q92878 1312 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 BAIAP3O94812 1187 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CXCL10P02778 98 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CKBP12277 381 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SELPP16109 830 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SESTD1Q86VW0 696 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ALG1Q9BT22 464 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SORBS3O60504 671 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GH1P01241 217 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CAGE1Q8TC20 777 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LINC01553A4QN01 128 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OPLAHO14841 1288 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GJB5O95377 273 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KCNJ6P48051 423 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PSEN2P49810 448 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RBL2Q08999 1139 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RMDN3Q96TC7 470 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 HAS3O00219 553 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RGS20O76081 388 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF286BP0CG31 522 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ERVK-21P61565 698 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RAD9AQ99638 391 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.54■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MYH6P13533 1939 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZMYM6O95789 1325 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 STXBP2Q15833 593 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 DGKHQ86XP1 1220 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PNMA1Q8ND90 353 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PNMA2Q9UL42 364 aa16.53■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ABCB11O95342 1321 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KDM4AO75164 1064 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NR3C2P08235 984 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SP2Q02086 613 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MFSD10Q14728 455 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 DGKDQ16760 1214 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 C7orf31Q8N865 590 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ANKS1AQ92625 1134 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 IWS1Q96ST2 819 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CRBNQ96SW2 442 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PXMP2Q9NR77 195 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.52■□□□□ 0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 B4DLN1 442 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 GPR37L1O60883 481 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 F2P00734 622 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 PTK7Q13308 1070 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 IL31RAQ8NI17 732 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 RILPL2Q969X0 211 aa16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
FCHO1-228ENST00000599236 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms