RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ALG1	Q9BT22	464 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	IPPK	Q9H8X2	491 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC66	A2RUB6	948 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GAS7	O60861	476 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF205	O95201	554 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MT-CO1	P00395	513 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PRNP	P04156	253 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	SOD2	P04179	222 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	APP	P05067	770 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ATF3	P18847	181 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GNAL	P38405	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PAK1	Q13153	545 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CHST14	Q8NCH0	376 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CABP5	Q9NP86	173 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608		H3BS24	57 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT37	O76014	449 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	NAT1	P18440	290 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PAM	P19021	973 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	TESK1	Q15569	626 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPN21	Q16825	1174 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP9	Q49MG5	647 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CDH19	Q9H159	772 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	TCFL5	Q9UL49	500 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CBLC	Q9ULV8	474 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNK3	O14649	394 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MYBL2	P10244	700 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GRK2	P25098	689 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GRK3	P35626	688 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	KIF18B	Q86Y91	864 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PASD1	Q8IV76	773 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	PMM1	Q92871	262 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	BTG4	Q9NY30	223 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ATP9B-223	ENST00000590608	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO21	O94952	628 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	WNT11	O96014	354 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	LSS	P48449	732 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	PSMD1	Q99460	953 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	CEACAM5	P06731	702 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT15	P19012	456 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ATP9B-223	ENST00000590608	BCL6	P41182	706 aa		6.51	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms