RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 GH1P01241 217 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 MMP3P08254 477 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 RBL2Q08999 1139 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 TCTN1Q2MV58 587 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 CHST3Q7LGC8 479 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 C7orf31Q8N865 590 aa10.74□□□□□ -0.69
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PTPRM-210ENST00000578916 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 TANC1Q9C0D5 1861 aa10.74□□□□□ -0.69
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PTPRM-210ENST00000578916 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
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PTPRM-210ENST00000578916 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
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PTPRM-210ENST00000578916 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 CLDND1Q9NY35 253 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRM-210ENST00000578916 H3BNC9 293 aa10.7□□□□□ -0.7
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PTPRM-210ENST00000578916 MBTPS1Q14703 1052 aa10.7□□□□□ -0.7
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PTPRM-210ENST00000578916 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.7□□□□□ -0.7
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PTPRM-210ENST00000578916 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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PTPRM-210ENST00000578916 PTPRSQ13332 1948 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.69□□□□□ -0.7
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PTPRM-210ENST00000578916 F2P00734 622 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 RSPH10BP0C881 870 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 IRS1P35568 1242 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 THPOP40225 353 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF543Q08ER8 600 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 LAMC2Q13753 1193 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 RPAINQ86UA6 219 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM192Q8IY95 271 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 SEPT8Q92599 483 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRM-210ENST00000578916 ANKS1AQ92625 1134 aa10.69□□□□□ -0.7
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