RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 MMP3P08254 477 aa22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 PBX2P40425 430 aa22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 HOMER1Q86YM7 354 aa22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 PBX4Q9BYU1 374 aa22.44■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 GRIN2CQ14957 1233 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SESTD1Q86VW0 696 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SKAP1Q86WV1 359 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 IL31RAQ8NI17 732 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 MYLIPQ8WY64 445 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SCLYQ96I15 445 aa22.43■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SLC27A2O14975 620 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SMARCA1P28370 1054 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 TRAF1Q13077 416 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 PGM5Q15124 567 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 TIFAQ96CG3 184 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 ZNF576Q9H609 170 aa22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 PRC1O43663 620 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 POLR2MP0CAP2 368 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SP2Q02086 613 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.41■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 PITPNM1O00562 1244 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 DDAH1O94760 285 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 LAMC2Q13753 1193 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 MYL10Q9BUA6 226 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.4■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.39■■□□□ 1.18
E2F4-209ENST00000567228 HAS3O00219 553 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 IQCF3P0C7M6 154 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MCM5P33992 734 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 LIFRP42702 1097 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 GPNMBQ14956 572 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 DGKDQ16760 1214 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 TMTC2Q8N394 836 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PPTC7Q8NI37 304 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 TMEM87BQ96K49 555 aa22.39■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MYH6P13533 1939 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 DLL1O00548 723 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 TGFB3P10600 412 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.38■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PPFIA4O75335 1185 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 F2P00734 622 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PFKMP08237 780 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MEIS2O14770 477 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 KIF5BP33176 963 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 RBL2Q08999 1139 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PTGISQ16647 500 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CASC1Q6TDU7 716 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 VCANP13611 3396 aa22.36■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PIK3CDO00329 1044 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 FOSL2P15408 326 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CCND2P30279 289 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 ICAM3P32942 547 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 RFC2P35250 354 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PSEN2P49810 448 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 HIC1Q14526 733 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
E2F4-209ENST00000567228 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms