RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CERS4Q9HA82 394 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 COL20A1Q9P218 1284 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 ZEB2O60315 1214 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PRC1O43663 620 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CABYRO75952 493 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 MCM5P33992 734 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CASC1Q6TDU7 716 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 HOMER1Q86YM7 354 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 SCFD2Q8WU76 684 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 VWCEQ96DN2 955 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PIGSQ96S52 555 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 RMDN3Q96TC7 470 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 LY9Q9HBG7 655 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 SCN5AQ14524 2016 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 OPLAHO14841 1288 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CYTH3O43739 400 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CFBP00751 764 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 KRT40Q6A162 431 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 MTA3Q9BTC8 594 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TTLL4Q14679 1199 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TMTC2Q8N394 836 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 IWS1Q96ST2 819 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 MYL10Q9BUA6 226 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CDC45O75419 566 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CA3P07451 260 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 CYP2C9P11712 490 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 HSD17B4P51659 736 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TRAF1Q13077 416 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 PPP2R5BQ15173 497 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM87BQ96K49 555 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 MAP3K14Q99558 947 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-222ENST00000567147 EPOPA6NHQ4 379 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CPT1AP50416 773 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 STXBP2Q15833 593 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RNF20Q5VTR2 975 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 COPS5Q92905 334 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 LCTP09848 1927 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC69A6NI79 296 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 DDAH1O94760 285 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 ARIH2O95376 493 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 NR3C2P08235 984 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 KIF5BP33176 963 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 LIFRP42702 1097 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 GHRHRQ02643 423 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 AAK1Q2M2I8 961 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PXMP2Q9NR77 195 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGEF15O94989 841 aa20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 MYL3P08590 195 aa20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.24■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 A6NJR5 290 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 POLR2MP0CAP2 368 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 LY6KQ17RY6 165 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 NEK1Q96PY6 1258 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms