RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.87■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 NID2Q14112 1375 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.87■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 APOBRQ0VD83 1088 aa22.86■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.86■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 A6NJR5 290 aa22.85■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 CDK7P50613 346 aa22.85■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 KIAA0355O15063 1070 aa22.84■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.84■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.84■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.83■■□□□ 1.25
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CMTM3-211ENST00000565922 CDC27P30260 824 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 NAPAP54920 295 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 FAAP100Q0VG06 881 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 FUT2Q10981 343 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 TDHQ8IZJ6 230 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 EVCP57679 992 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ANAPC15P60006 121 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGAP1Q07960 439 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 LAMC2Q13753 1193 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 IL31RAQ8NI17 732 aa22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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CMTM3-211ENST00000565922 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.81■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 MMP3P08254 477 aa22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 AFG1LQ8WV93 481 aa22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 BADQ92934 168 aa22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 BARHL2Q9NY43 387 aa22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 TBX21Q9UL17 535 aa22.8■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 FIBPO43427 364 aa22.79■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 RGS20O76081 388 aa22.79■■□□□ 1.24
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CMTM3-211ENST00000565922 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 NLRX1Q86UT6 975 aa22.79■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PPTC7Q8NI37 304 aa22.79■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.79■■□□□ 1.24
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CMTM3-211ENST00000565922 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 CD4P01730 458 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 SCG2P13521 617 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ICAM3P32942 547 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 ADCY7P51828 1080 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PSMC6P62333 389 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 CDHR1Q96JP9 859 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 GRIN2DO15399 1336 aa22.78■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 STXBP3O00186 592 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 GGPS1O95749 300 aa22.77■■□□□ 1.24
CMTM3-211ENST00000565922 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.77■■□□□ 1.24
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