RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 SAMD11Q96NU1 681 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.73■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 GPM6BQ13491 265 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 CHST3Q7LGC8 479 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 CLDND1Q9NY35 253 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 PNMA2Q9UL42 364 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 LGR5O75473 907 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 GH1P01241 217 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 IRS1P35568 1242 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 PTK7Q13308 1070 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 KAT2BQ92831 832 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 GPATCH3Q96I76 525 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 PHOX2BQ99453 314 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 ALG1Q9BT22 464 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4B-211ENST00000559322 H3BNC9 293 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 MS4A1P11836 297 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DGKDQ16760 1214 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 ST18O60284 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 LY6KQ17RY6 165 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 YME1L1Q96TA2 773 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 EMSYQ7Z589 1322 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PSEN2P49810 448 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPN5P54829 565 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 CCER2I3L3R5 266 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 NCK2O43639 380 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP1Q07960 439 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 MBTPS1Q14703 1052 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 RPAINQ86UA6 219 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM192Q8IY95 271 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PRSS33Q8NF86 280 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 INCENPQ9NQS7 918 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 MFSD10Q14728 455 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 COL19A1Q14993 1142 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 CLUL1Q15846 466 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXO11Q86XK2 927 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 WNT8BQ93098 351 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 UPP2O95045 317 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 RNF135Q8IUD6 432 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 PRRX2Q99811 253 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.64■■□□□ 1.22
SEMA4B-211ENST00000559322 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 RSPH10BP0C881 870 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF286BP0CG31 522 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 THPOP40225 353 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 USH1GQ495M9 461 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 EDAQ92838 391 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 TOMM22Q9NS69 142 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 F2P00734 622 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 LTBRP36941 435 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 NOVP48745 357 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 MBTPS2O43462 519 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 STXBP2Q15833 593 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 PKN1Q16512 942 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 IER5LQ5T953 404 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 SEPT8Q92599 483 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 TOP1MTQ969P6 601 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 STXBP3O00186 592 aa22.61■■□□□ 1.21
SEMA4B-211ENST00000559322 PDHBP11177 359 aa22.61■■□□□ 1.21
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