RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 GPNMBQ14956 572 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 DGKDQ16760 1214 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 ALG1Q9BT22 464 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.93■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 DCXO43602 365 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 AMHP03971 560 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 PTK7Q13308 1070 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 LY6KQ17RY6 165 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 USH1GQ495M9 461 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.92■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 PDHBP11177 359 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 KAT2BQ92831 832 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNH6Q9H252 994 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 DCTPP1Q9H773 170 aa20.91■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 EMSYQ7Z589 1322 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 PSEN2P49810 448 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 ARHGAP1Q07960 439 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 STXBP2Q15833 593 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 RGS22Q8NE09 1264 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 SAMD11Q96NU1 681 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.9■□□□□ 0.94
TSPAN3-204ENST00000558394 LGR5O75473 907 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF543Q08ER8 600 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MFSD10Q14728 455 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 NEK9Q8TD19 979 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 NHLH1Q02575 133 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TCTN1Q2MV58 587 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.934e-8■■■□□ 17.1
TSPAN3-204ENST00000558394 BANK1Q8NDB2 785 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 IWS1Q96ST2 819 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 LAMC2Q13753 1193 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 EPC2Q52LR7 807 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 FBXL18Q96ME1 805 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TTC14Q96N46 770 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 YME1L1Q96TA2 773 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 RMDN3Q96TC7 470 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MAF1Q9H063 256 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ABCB11O95342 1321 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 FOXP2O15409 715 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 FGRP09769 529 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF286BP0CG31 522 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 GPM6BQ13491 265 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 VPS53Q5VIR6 699 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MIER1Q8N108 512 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 F2P00734 622 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 RSPH10BP0C881 870 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 THPOP40225 353 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ALX1Q15699 326 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 PPTC7Q8NI37 304 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 POTEB3A0JP26 581 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 H3BNC9 293 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 POTEBQ6S5H4 581 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 CLDND1Q9NY35 253 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 MYH6P13533 1939 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN3-204ENST00000558394 NCK2O43639 380 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms