RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 FERMT3Q86UX7 667 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 ALG3Q92685 438 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.45□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 SH3D21A4FU49 640 aa7.44□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 K7ESM1 405 aa7.44□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.44□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.44□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 GLI4P10075 376 aa7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.43□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 FEZ1Q99689 392 aa7.42□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.42□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.42□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.41□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.41□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.41□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 CARFQ8N187 725 aa7.41□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.41□□□□□ -1.22
USP15-218ENST00000552346 GPR20Q99678 358 aa7.41□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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USP15-218ENST00000552346 NETO2Q8NC67 525 aa7.38□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.38□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 PEX11GQ96HA9 241 aa7.38□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.37□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.37□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.37□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 NTMQ9P121 344 aa7.37□□□□□ -1.23
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USP15-218ENST00000552346 SEPHS1P49903 392 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 AMPD3Q01432 767 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 GNPTABQ3T906 1256 aa7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP15-218ENST00000552346 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.36□□□□□ -1.23
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