RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 LGR5O75473 907 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SLC16A2P36021 539 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 BANK1Q8NDB2 785 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TET1Q8NFU7 2136 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 NMT2O60551 498 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ARIH2O95376 493 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ZP2Q05996 745 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 KAT2BQ92831 832 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SIP14410 1827 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 C19orf67A6NJJ6 358 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 H3BNC9 293 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ORC4O43929 436 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PSEN2P49810 448 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ARHGAP1Q07960 439 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 GPM6BQ13491 265 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 STXBP2Q15833 593 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 EPC2Q52LR7 807 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 YME1L1Q96TA2 773 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PRRX2Q99811 253 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 FSD1Q9BTV5 496 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PTPRSQ13332 1948 aa14□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 LAMC2Q13753 1193 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 MFSD10Q14728 455 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PKN1Q16512 942 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 LY6KQ17RY6 165 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CHST3Q7LGC8 479 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 IWS1Q96ST2 819 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ALG1Q9BT22 464 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TOMM22Q9NS69 142 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 F2P00734 622 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PDHBP11177 359 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 COL19A1Q14993 1142 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TCTN1Q2MV58 587 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 FBXO11Q86XK2 927 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TMEM192Q8IY95 271 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PPTC7Q8NI37 304 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TTC14Q96N46 770 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CLDND1Q9NY35 253 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ABCB11O95342 1321 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HAS3O00219 553 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ST18O60284 1047 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 RSPH10BP0C881 870 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PTPN5P54829 565 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 ZNF543Q08ER8 600 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 USH1GQ495M9 461 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 SEPT8Q92599 483 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 RWDD3Q9Y3V2 267 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 COL4A6Q14031 1691 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 CAND2O75155 1236 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
CS-228ENST00000551473 FGRP09769 529 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms