RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548135.1

AC055736.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC055736.1, Length 629 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC055736.1-201ENST00000548135 TBC1D5Q92609 795 aa9.51□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TTC14Q96N46 770 aa9.51□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CPVLQ9H3G5 476 aa9.51□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 A0A0D9SFI3 127 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 LINC01553A4QN01 128 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 GPR37L1O60883 481 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 NBNO60934 754 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 GJB5O95377 273 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CXCL10P02778 98 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CKBP12277 381 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ERVK-21P61565 698 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RBL2Q08999 1139 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 AAMPQ13685 434 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 IKBKEQ14164 716 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 STXBP2Q15833 593 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 DGKDQ16760 1214 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TCTN1Q2MV58 587 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 FAM227BQ96M60 508 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RAD9AQ99638 391 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ALG1Q9BT22 464 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 LNPKQ9C0E8 428 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CD320Q9NPF0 282 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZMYM6O95789 1325 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.5□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 EFCAB14O75071 495 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PSEN2P49810 448 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RILPL2Q969X0 211 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 IWS1Q96ST2 819 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RMDN3Q96TC7 470 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MAF1Q9H063 256 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 COL20A1Q9P218 1284 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ABCB11O95342 1321 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 LAMA4Q16363 1823 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.49□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZNF286BP0CG31 522 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 KCNA5P22460 613 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 PTK7Q13308 1070 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 LAMC2Q13753 1193 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MFSD10Q14728 455 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 DGKHQ86XP1 1220 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 GJD3Q8N144 294 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 ESR2Q92731 530 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 WNT8BQ93098 351 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.48□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 HAS3O00219 553 aa9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 LGR5O75473 907 aa9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 F2P00734 622 aa9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 NR3C2P08235 984 aa9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 MBTPS1Q14703 1052 aa9.47□□□□□ -0.89
AC055736.1-201ENST00000548135 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms