RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	DCTPP1	Q9H773	170 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490		M0R2C6	588 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP2A1	O14983	1001 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	KIAA0355	O15063	1070 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	AXIN1	O15169	862 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	ZBED4	O75132	1171 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	ADAMTS4	O75173	837 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	RAG1	P15918	1043 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	GNAT2	P19087	354 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	TDO2	P48775	406 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	ACLY	P53396	1101 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	EPHB4	P54760	987 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CLDN10	P78369	228 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	FAAP100	Q0VG06	881 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	KCNA10	Q16322	511 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490		Q6ZVU0	165 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	MKL1	Q969V6	931 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	KIFC2	Q96AC6	838 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CEP95	Q96GE4	821 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	GPATCH3	Q96I76	525 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		6.96	□□□□□ -1.29
DYRK4-208	ENST00000539490	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TTLL1	O95922	423 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TSPY3	P0CV98	308 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TSPY8	P0CW00	308 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	RELB	Q01201	579 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ACVR2B	Q13705	512 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SLFN13	Q68D06	897 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	MYLIP	Q8WY64	445 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TOX2	Q96NM4	488 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	FEM1B	Q9UK73	627 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	MYADML2	A6NDP7	307 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM232	C9JQI7	657 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ADCY6	O43306	1168 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	UPP2	O95045	317 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TIMP1	P01033	207 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ASGR1	P07306	291 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	BMP3	P12645	472 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	CDK7	P50613	346 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	OAZ1	P54368	228 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	TFAP4	Q01664	338 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	FPGS	Q05932	587 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	PDE4B	Q07343	736 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490		Q6ZNB5	142 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	ARMCX2	Q7L311	632 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DYRK4-208	ENST00000539490	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms