RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ASB14A6NK59 587 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TBX3O15119 743 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 EDIL3O43854 480 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MARCH6O60337 910 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D8O95759 1140 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PGK2P07205 417 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 OR52Z1P0C646 297 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PRPHP41219 470 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ME1P48163 572 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 STXBP2Q15833 593 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CALCRLQ16602 461 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CEP55Q53EZ4 464 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PRR16Q569H4 304 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 DPP9Q86TI2 863 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 POTEDQ86YR6 584 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 IL31RAQ8NI17 732 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MGAMO43451 1857 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.57□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FAM86B1E9PN63 330 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SLC37A4O43826 429 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 EDNRBP24530 442 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SP3Q02447 781 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PDE4DQ08499 809 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MAP2K5Q13163 448 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 GNPTABQ3T906 1256 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MORN1Q5T089 497 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 NLRX1Q86UT6 975 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.56□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MEIS1O00470 390 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MAFGO15525 162 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CUTAO60888 179 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 RGS2P41220 211 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 UBE2HP62256 183 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 NFKBIBQ15653 356 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 C4orf32Q8N8J7 132 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 GPRASP2Q96D09 838 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CDHR1Q96JP9 859 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FAM20AQ96MK3 541 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MTMR9Q96QG7 549 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 RAB34Q9BZG1 259 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TMEM60Q9H2L4 133 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 JADE2Q9NQC1 790 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ASTN1O14525 1302 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.55□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 COBLO75128 1261 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 HOXC6P09630 235 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PSMC4P43686 418 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MTMR1Q13613 665 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ARHGEF6Q15052 776 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ADALQ6DHV7 355 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MORC4Q8TE76 937 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 LENG9Q96B70 501 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FGD4Q96M96 766 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 APBA2Q99767 749 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.54□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PQ27 194 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PQ64 194 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PQD8 194 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 GPR25O00155 361 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ITGB5P18084 799 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 LONP1P36776 959 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms