RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MRIQ9BWK5 157 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 EDIL3O43854 480 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 POLR2MP0CAP2 368 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CDC25BP30305 580 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MKL1Q969V6 931 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PNMA5Q96PV4 448 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.319e-11■□□□□ 11.3
PTPRK-216ENST00000524481 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 HMGCS2P54868 508 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TGFB2P61812 414 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 RGS22Q8NE09 1264 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 AGBL3Q8NEM8 1001 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 AK8Q96MA6 479 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 VCPKMTQ9H867 229 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TMX2Q9Y320 296 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ABCB11O95342 1321 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NFIBO00712 420 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 SMARCA1P28370 1054 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KRT9P35527 623 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KLK7P49862 253 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ARID5AQ03989 594 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MTMR9Q96QG7 549 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PICK1Q9NRD5 415 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PANK4Q9NVE7 773 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GGA3Q9NZ52 723 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 COPB1P53618 953 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GNG11P61952 73 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ESYT2A0FGR8 921 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MED24O75448 989 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TPM2P07951 284 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PLA2G4BP0C869 781 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TCERG1LQ5VWI1 586 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 SPATA20Q8TB22 786 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PRPHP41219 470 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CNTNAP1P78357 1384 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TNFAIP1Q13829 316 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TFR2Q9UP52 801 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0U1RQJ8 604 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GAS7O60861 476 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF18P17022 549 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NT5C2P49902 561 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KSR1Q8IVT5 923 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ADSSL1Q8N142 457 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 RDH13Q8NBN7 331 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 RWDD2AQ9UIY3 292 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 DNM3Q9UQ16 869 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF541Q9H0D2 1346 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CLSTN1O94985 981 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 NR1I3Q14994 352 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GMCL1Q96IK5 515 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MSH4O15457 936 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KLRC4O43908 158 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 BANK1Q8NDB2 785 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 RAD54LQ92698 747 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 P2RX5Q93086 422 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms